MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004842	CCG	2	6	224520	224525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416548
3502	NC_004842	CCA	2	6	224607	224612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416548
3503	NC_004842	TGT	2	6	224616	224621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416548
3504	NC_004842	CG	4	8	224640	224647	0 %	0 %	50 %	50 %	56416548
3505	NC_004842	TGCG	2	8	224665	224672	0 %	25 %	50 %	25 %	56416548
3506	NC_004842	CTT	2	6	224701	224706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416548
3507	NC_004842	TCAA	2	8	224864	224871	50 %	25 %	0 %	25 %	56416548
3508	NC_004842	ACTG	2	8	224941	224948	25 %	25 %	25 %	25 %	56416548
3509	NC_004842	TA	4	8	225037	225044	50 %	50 %	0 %	0 %	56416548
3510	NC_004842	TG	3	6	225506	225511	0 %	50 %	50 %	0 %	56416549
3511	NC_004842	GAG	2	6	225526	225531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416549
3512	NC_004842	CTGA	2	8	225559	225566	25 %	25 %	25 %	25 %	56416549
3513	NC_004842	A	6	6	225622	225627	100 %	0 %	0 %	0 %	56416549
3514	NC_004842	AAAT	2	8	225650	225657	75 %	25 %	0 %	0 %	56416549
3515	NC_004842	T	6	6	225763	225768	0 %	100 %	0 %	0 %	56416549
3516	NC_004842	ACG	2	6	225857	225862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3517	NC_004842	CCA	2	6	225992	225997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416549
3518	NC_004842	GTA	2	6	226193	226198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416549
3519	NC_004842	GGA	2	6	226207	226212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416549
3520	NC_004842	AGC	2	6	226215	226220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3521	NC_004842	ATA	2	6	226250	226255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416549
3522	NC_004842	GCAG	2	8	226278	226285	25 %	0 %	50 %	25 %	56416549
3523	NC_004842	CGT	2	6	226350	226355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3524	NC_004842	AGC	2	6	226363	226368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3525	NC_004842	GTG	2	6	226379	226384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416549
3526	NC_004842	CAT	2	6	226476	226481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416549
3527	NC_004842	CGA	2	6	226554	226559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3528	NC_004842	AGGGGC	2	12	226601	226612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	56416549
3529	NC_004842	TCT	2	6	226663	226668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416549
3530	NC_004842	TCT	2	6	226693	226698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416549
3531	NC_004842	CGC	2	6	226717	226722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416549
3532	NC_004842	TG	3	6	226814	226819	0 %	50 %	50 %	0 %	56416549
3533	NC_004842	ACG	2	6	226871	226876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3534	NC_004842	GCA	2	6	226904	226909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3535	NC_004842	ACG	2	6	227044	227049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3536	NC_004842	TGA	2	6	227079	227084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416549
3537	NC_004842	AC	3	6	227150	227155	50 %	0 %	0 %	50 %	56416549
3538	NC_004842	TGCA	2	8	227260	227267	25 %	25 %	25 %	25 %	56416549
3539	NC_004842	AAG	2	6	227320	227325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416549
3540	NC_004842	AGGTT	2	10	227387	227396	20 %	40 %	40 %	0 %	56416549
3541	NC_004842	CAGT	2	8	227405	227412	25 %	25 %	25 %	25 %	56416549
3542	NC_004842	CG	3	6	227508	227513	0 %	0 %	50 %	50 %	56416549
3543	NC_004842	TG	3	6	227521	227526	0 %	50 %	50 %	0 %	56416549
3544	NC_004842	GGTAC	2	10	227695	227704	20 %	20 %	40 %	20 %	56416549
3545	NC_004842	AGTTGG	2	12	227772	227783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56416549
3546	NC_004842	AGC	2	6	227914	227919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3547	NC_004842	CTG	2	6	227954	227959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3548	NC_004842	TGC	2	6	228102	228107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3549	NC_004842	GC	3	6	228131	228136	0 %	0 %	50 %	50 %	56416549
3550	NC_004842	GAT	2	6	228139	228144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416549
3551	NC_004842	AGCA	2	8	228160	228167	50 %	0 %	25 %	25 %	56416549
3552	NC_004842	TTG	2	6	228168	228173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416549
3553	NC_004842	TAC	2	6	228200	228205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416549
3554	NC_004842	AAT	2	6	228217	228222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416549
3555	NC_004842	GCA	2	6	228253	228258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3556	NC_004842	AGAA	2	8	228299	228306	75 %	0 %	25 %	0 %	56416549
3557	NC_004842	AGC	2	6	228452	228457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416549
3558	NC_004842	TGA	2	6	228519	228524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416549
3559	NC_004842	TTG	2	6	228689	228694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416549
3560	NC_004842	ATT	2	6	229048	229053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416550
3561	NC_004842	TGA	2	6	229142	229147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416550
3562	NC_004842	TG	3	6	229160	229165	0 %	50 %	50 %	0 %	56416550
3563	NC_004842	ATA	2	6	229172	229177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416550
3564	NC_004842	GCC	2	6	229212	229217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416550
3565	NC_004842	C	6	6	229294	229299	0 %	0 %	0 %	100 %	56416550
3566	NC_004842	AGC	2	6	229300	229305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416550
3567	NC_004842	ATG	2	6	229363	229368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416550
3568	NC_004842	ACA	2	6	229427	229432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416550
3569	NC_004842	GA	4	8	229454	229461	50 %	0 %	50 %	0 %	56416550
3570	NC_004842	GCAC	2	8	229479	229486	25 %	0 %	25 %	50 %	56416550
3571	NC_004842	AGC	2	6	229791	229796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416551
3572	NC_004842	CA	3	6	229832	229837	50 %	0 %	0 %	50 %	56416551
3573	NC_004842	GT	3	6	229858	229863	0 %	50 %	50 %	0 %	56416551
3574	NC_004842	GTGG	2	8	229903	229910	0 %	25 %	75 %	0 %	56416551
3575	NC_004842	GCC	2	6	229918	229923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416551
3576	NC_004842	T	6	6	230041	230046	0 %	100 %	0 %	0 %	56416551
3577	NC_004842	AGC	2	6	230091	230096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416551
3578	NC_004842	GCC	2	6	230101	230106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416551
3579	NC_004842	G	6	6	230119	230124	0 %	0 %	100 %	0 %	56416551
3580	NC_004842	TA	3	6	230135	230140	50 %	50 %	0 %	0 %	56416551
3581	NC_004842	CTT	2	6	230146	230151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416551
3582	NC_004842	GCG	2	6	230152	230157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416551
3583	NC_004842	CAC	2	6	230175	230180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416551
3584	NC_004842	GAG	2	6	230185	230190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416551
3585	NC_004842	TCC	2	6	230199	230204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416551
3586	NC_004842	TG	3	6	230276	230281	0 %	50 %	50 %	0 %	56416551
3587	NC_004842	CCAT	2	8	230353	230360	25 %	25 %	0 %	50 %	56416551
3588	NC_004842	T	6	6	230412	230417	0 %	100 %	0 %	0 %	56416551
3589	NC_004842	CAG	2	6	230418	230423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416551
3590	NC_004842	ACT	2	6	230583	230588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416551
3591	NC_004842	T	6	6	230627	230632	0 %	100 %	0 %	0 %	56416551
3592	NC_004842	TGG	2	6	230816	230821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416551
3593	NC_004842	TGG	2	6	230834	230839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416551
3594	NC_004842	TGCA	2	8	230907	230914	25 %	25 %	25 %	25 %	56416551
3595	NC_004842	GTG	2	6	231328	231333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416552
3596	NC_004842	GTT	2	6	231360	231365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416552
3597	NC_004842	GTG	2	6	231388	231393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416552
3598	NC_004842	GCT	2	6	231444	231449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416552
3599	NC_004842	GAA	2	6	231484	231489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416552
3600	NC_004842	ATT	2	6	231541	231546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416552
3601	NC_004842	GC	3	6	231638	231643	0 %	0 %	50 %	50 %	56416552
3602	NC_004842	GTG	2	6	231674	231679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416552
3603	NC_004842	GCAT	2	8	231840	231847	25 %	25 %	25 %	25 %	56416552
3604	NC_004842	T	6	6	231948	231953	0 %	100 %	0 %	0 %	56416553
3605	NC_004842	TCG	2	6	231989	231994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416553
3606	NC_004842	CTC	2	6	232032	232037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416553
3607	NC_004842	T	6	6	232167	232172	0 %	100 %	0 %	0 %	56416553
3608	NC_004842	AC	3	6	232239	232244	50 %	0 %	0 %	50 %	56416553
3609	NC_004842	GCC	2	6	232270	232275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416553
3610	NC_004842	TGG	2	6	232389	232394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416553
3611	NC_004842	A	6	6	232465	232470	100 %	0 %	0 %	0 %	56416553
3612	NC_004842	CAG	2	6	232554	232559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416553
3613	NC_004842	CAG	3	9	232599	232607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416553
3614	NC_004842	TCC	2	6	232629	232634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416553
3615	NC_004842	CAA	2	6	232701	232706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416553
3616	NC_004842	TGC	2	6	232710	232715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416553
3617	NC_004842	ACT	2	6	232805	232810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416554
3618	NC_004842	T	6	6	232869	232874	0 %	100 %	0 %	0 %	56416554
3619	NC_004842	TGT	2	6	232960	232965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416554
3620	NC_004842	AAC	2	6	232976	232981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416554
3621	NC_004842	GTA	2	6	233048	233053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416554
3622	NC_004842	ACTA	2	8	233059	233066	50 %	25 %	0 %	25 %	56416554
3623	NC_004842	TCG	2	6	233120	233125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416554
3624	NC_004842	CGC	2	6	233183	233188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416554
3625	NC_004842	GGA	2	6	233200	233205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416554
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3862	NC_004842	CG	3	6	246711	246716	0 %	0 %	50 %	50 %	56416565
3863	NC_004842	ATG	2	6	246828	246833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416565
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3872	NC_004842	TGC	2	6	247087	247092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416565
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3875	NC_004842	TGG	2	6	247153	247158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416565
3876	NC_004842	GGA	2	6	247210	247215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416565
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3878	NC_004842	CGA	2	6	247251	247256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416565
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3882	NC_004842	TGC	2	6	249123	249128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416566
3883	NC_004842	T	6	6	249169	249174	0 %	100 %	0 %	0 %	56416566
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3887	NC_004842	GCT	2	6	249273	249278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416566
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3942	NC_004842	CGC	2	6	252149	252154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416570
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3994	NC_004842	GCG	2	6	254599	254604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416572
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3996	NC_004842	T	6	6	254984	254989	0 %	100 %	0 %	0 %	56416573
3997	NC_004842	TCA	3	9	255007	255015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416573
3998	NC_004842	ACC	2	6	255031	255036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416573
3999	NC_004842	TTG	2	6	255234	255239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416573
4000	NC_004842	AACT	2	8	255243	255250	50 %	25 %	0 %	25 %	56416573

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